En 1969, durante una estancia en Austria por motivos académicos, el indonesio Agus Prawoto conoció de cerca la filosofía y las instalaciones de Aldeas Infantiles SOS. Impresionado por el concepto y atraído por la alegre atmósfera de las Aldeas Infantiles SOS, quiso brindar también a los niños huérfanos y abandonados de su país la posibilidad de crecer en la seguridad de una Aldea Infantil SOS. Después de volver a Indonesia en el año 1970, el Sr. Prawoto comenzó inmediatamente con los preparativos para la creación de la primera Aldea Infantil SOS, en Lembang, una localidad situada en la parte occidental de la Isla de Java, a 16 km al norte de la ciudad de Bandung. La asociación nacional SOS Desa Taruna Indonesia se constituyó legalmente en el año 1971, y en septiembre del año siguiente, las primeras familias pudieron trasladarse a su nuevo hogar.
A lo largo de los años, se construyeron más Aldeas Infantiles SOS con instituciones anexas en otras regiones del estado insular para beneficio de los niños y jóvenes desamparados. Así surgieron las isntalaciones SOS en Yakarta y Semarang; Java; Tabanan (Bali); y en 1992, como resultado de las medidas tomadas tras un tsunami, también en Maumere (Flores). En el año 1999, debido a los graves conflictos militares acaecidos en Timor Oriental entre las tropas del Gobierno de Indonesia y los soldados a favor de la independencia, SOS Desa Taruna Indonesia, la Asociación Nacional de Aldeas Infantiles SOS de Indonesia, lanzó un Programa de Emergencia SOS con el que más de 100 refugiados de un orfanato en Dili (la capital de Timor Oriental) fueron acogidos en la Aldea Infantil SOS Flores durante el tiempo en que duró la guerra.
El 26 de diciembre de 2004 se registró un terremoto con una magnitud de 9.3, justo en la costa de Sumatra que ocasionó una serie de tsunamis en las áreas costeras del Océano Índico. La costa noroeste de Sumatra fue la más perjudicada, y donde se contabilizaron más de 100 000 muertos. Hasta ese momento, Aldeas Infantiles SOS de Indonesia no tenía instalaciones en la isla, pero no dudó en poner en marcha rápidamente, y bajo condiciones muy difíciles, medidas para ayuda de emergencia a niños traumatizados y familias que habían perdido sus hogares. A este programa le siguió la construcción de más de 500 casas privadas y varios centros comunitarios para las comunidades locales de cerca de Banda Aceh y Meulaboh. Las generosas donaciones y la estrecha cooperación con las autoridades locales hicieron que a lo largo del 2007 pudieran abrirse tres Aldeas Infantiles SOS, con un Jardín de Infancia SOS anexo.
En el año 2005 se puso en funcionamiento el primer Programa de Fortalecimiento de Familias SOS, con el que se pretende que los niños que corren el riesgo de ser abandonados puedan seguir siendo atendidos por su propia familia biológica. Para lograrlo, SOS Desa Taruna Indonesia trabaja directamente con las familias y comunidades, en cooperación con autoridades locales y otros proveedores de servicios, fortaleciéndolas y ayudándolas a que cuiden de la mejor manera posible a sus hijos.
En el año 2006 un fuerte terremoto azotó duramente la ciudad de Yogyakarta y el Hogar Juvenil SOS Timoho facilitó ayuda de emergencia a las víctimas, con lo que se fortaleció a las familias del área afectada. Al año siguiente, se produjo una gran inundación en Yakarta, y de nuevo, SOS Desa Taruna Indonesia organizó diversas medidas de ayuda de emergencia.
Actualmente en Indonesia hay seis Aldeas Infantiles SOS, cinco Hogares Juveniles SOS, cinco Jardines de Infancia SOS, una Escuela SOS Hermann Gmeiner, un Centro de Formación Profesional SOS y nueve Centros Sociales SOS.
Página web de Aldeas Infantiles SOS Indonesia
(disponible en indonesio)